RELAZIONE ANNUALE AL PNI 2016

Laboratorio Nazionale di Riferimento per Escherichia coli
Istituto Superiore di Sanità

Prova Interlaboratorio PT17

Lo studio consisteva nell’identificazione e isolamento di STEC da campioni di carne bovina macinata contaminati con diverse quantità di un ceppo STEC O91. Questo sierogruppo non appartiene ai cosiddetti sierogruppi STEC top-five, ma è stato isolato da campioni di carne ed è il sesto sierogruppo tra quelli maggiormente riportati come causa di infezione umana in Europa nel periodo 2012-2014.

La scelta di questa particolare matrice si basa sulle seguenti considerazioni:

• I bovini rappresentano il serbatoio principale degli STEC e la carne bovina è un alimento tradizionalmente associato all’infezione da STEC.
• La carne bovina macinata è stata riconosciuta quale veicolo di infezione da STEC in numerose epidemie, tra le quali anche quella avvenuta negli anni ‘80 in USA, quando il ceppo STEC O157 fu identificato per la prima volta.
• Sebbene non siano stati stabiliti criteri microbiologici per tale matrice alimentare, la carne bovina è sempre più̀ frequentemente saggiata per la presenza di STEC nei laboratori coinvolti nel controllo ufficiale degli alimenti.
• Questa matrice non era stata mai oggetto degli studi inter-laboratorio organizzati dal LNR per E. coli.

Valutazione complessiva
Nella fase di screening mediante Real Time PCR, tutti i 18 laboratori (100 %) hanno identificato correttamente la presenza di STEC, nonostante un laboratorio non sia stato in grado di identificare entrambi i geni stx. Tredici laboratori (72,2 %) hanno ottenuto l’isolamento del ceppo STEC O91 dal campione contenente un’alta carica di ceppo STEC contaminante e 12 dal campione con bassa carica (66,7 %).

Nella carne utilizzata come matrice dello studio inter-laboratorio era presente un ceppo EPEC O26, non omogeneamente distribuito nelle porzioni da saggiare, che ha dato luogo ad alcune positività̀ in Real Time PCR ai geni eae e wzx. Non sono stati assegnati punti di penalità̀ ai laboratori che hanno riportato tali positività̀.

Diciassette dei 18 laboratori partecipanti hanno mostrato una performance soddisfacente.
L’unico laboratorio che non ha ottenuto tale risultato ha mostrato una difficoltà nell’identificazione del gene stx1.

Nel complesso, i risultati dello studio indicano che in Italia esiste un numero elevato di laboratori coinvolti nel controllo ufficiale degli alimenti, distribuiti sulla maggior parte del territorio nazionale, in grado di effettuare correttamente la ricerca dei STEC negli alimenti

Prova Interlaboratorio PT18

Lo studio consisteva nell’identificazione di ceppi di E. coli appartenenti a diversi gruppi patogeni sulla base della presenza dei geni di virulenza e caratterizzazione dei sierogruppi

La scelta di questa particolare matrice si basa sulle seguenti considerazioni:

• I ceppi di E. coli patogeni appartengono a un numero elevato di popolazioni in grado di causare malattia nell’uomo caratterizzata da diverse sintomatologie
• Sono tutti indistinguibili fenotipicamente dai ceppi di E. coli commensali
• Non tutti i ceppi di E. coli patogeni hanno un’origine zoonotica, ma la maggior parte di essi può essere trasmessa per via alimentare
• È importante che i laboratori siano in grado di riconoscere i diversi patogruppi per garantire la salubrità degli alimenti e per fornire supporto alle indagini epidemiologiche sui focolai di infezione

Valutazione complessiva
14 laboratori (93 %) hanno identificato correttamente il ceppo STEC e il genotipo completo. Un laboratorio non ha identificato entrambi i geni stx. Due laboratori non hanno identificato correttamente il genotipo del ceppo ETEC. I rimanenti laboratori hanno correttamente identificato gli altri patogruppi di E. coli (EPEC ed EAEC)

Nel complesso, i risultati dello studio indicano che in Italia esiste un’eccellente capacità di identificare correttamente i ceppi di E. coli appartenenti ai diversi gruppi patogeni. laboratori coinvolti nel controllo ufficiale degli alimenti, distribuiti sulla maggior parte del territorio nazionale, in grado di effettuare correttamente la ricerca dei STEC negli alimenti.