La ricerca è attuata attraverso la programmazione triennale dei progetti istituzionali degli organismi di ricerca riconosciuti.
La pianificazione dell'attività di ricerca sanitaria, coerente con l’area di riconoscimento del carattere scientifico di ciascun IRCCS e con l’attività assistenziale svolta, rappresenta la base sulla quale costruire programmi e progetti in accordo con le priorità indicate dal Programma nazionale della Ricerca Sanitaria.
Le linee di ricerca e gli obiettivi dell'attività 2022-2024 degli IRCCS
Con il decreto direttoriale del 23 Dicembre 2021, registrato alla Corte dei Conti il 19 Gennaio 2022, sono stati approvati gli indirizzi dell'attività di ricerca corrente, per il triennio 2022-2024, degli IRCCS di diritto pubblico e privato, nonché i criteri di ripartizione del finanziamento dell'attività.
Nel periodo 2022-2024 l'attività di ricerca corrente degli Istituti di ricovero e cura a carattere scientifico, nell'ambito delle rispettive aree di riconoscimento, è articolata secondo le linee di ricerca e gli obiettivi indicati nel documento:
Sulla piattaforma dedicata al monitoraggio delle attività di ricerca nell'area pubblica del Workflow della Ricerca è possibile consultare sia l’elenco dei progetti di ricerca corrente sia l’elenco delle pubblicazioni degli IRCCS.
Le linee dell'attività di ricerca 2022-2024 di AGENAS
Con il decreto direttoriale del 22 Dicembre 2022, registrato alla Corte dei Conti In data 8 marzo 2023, sono stati approvati gli indirizzi dell'attività di ricerca corrente, per il triennio 2022-2024, dell’Agenzia nazionale per i servizi sanitari regionali (AGENAS).
Nel periodo 2022-2024 l'attività di ricerca corrente AGENAS è articolata secondo le linee di attività nel documento:
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Credito di imposta per i Policlinici universitari: 10 milioni di euro per l’assunzione di personale a tempo indeterminato 
