Direzione generale Programmazione sanitaria, livelli di assistenza e principi etici di sistema
Direttore generale Prof. Francesco Bevere

Direzione generale Risorse umane e professioni sanitarie
Direttore generale Dott. Giovanni Leonardi

Direzione generale Sistema informativo
Direttore generale Dott.ssa Rossana Ugenti

Segreteria generale del Consiglio Superiore di sanità

Segretario generale

Rappresentante del Ministero presso la SISAC

Direttore generale Dott. Giuseppe Viggiano

Dipartimento dell'Innovazione
Capo Dipartimento ad interim Dott. Romano Marabelli

Direzione generale Farmaci e dispositivi medici
Direttore generale Dott.ssa Marcella Marletta


Direzione generale Ricerca scientifica e tecnologica
Direttore generale Dott. Massimo Casciello

Direzione generale Personale, organizzazione e bilancio
Direttore generale Dott. Giuseppe Celotto

Dipartimento Prevenzione e Comunicazione
Capo Dipartimento Dott. Fabrizio Oleari

Direzione generale Prevenzione sanitaria
Direttore generale

Direzione generale Comunicazione e relazioni istituzionali
Direttore generaleDott.ssa Daniela Rodorigo

Direzione generale Rapporti con l'Unione europea e rapporti internazionali
Direttore generale Dott. Giuseppe Ruocco

Dipartimento per la sanità pubblica veterinaria, la nutrizione e la sicurezza degli alimenti
Capo Dipartimento Dott. Romano Marabelli

Direzione generale della Sanità animale e del farmaco veterinario
Direttore generale Dott.ssa Gaetana Ferri

Direzione generale della Sicurezza degli alimenti e della nutrizione
Direttore generale Dott. Silvio Borrello

Segretariato nazionale della valutazione del rischio della catena alimentare